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本文标题:"菌群中鉴别微生物-培养的细胞检测显微镜"

发布者:yiyi ------ 分类: 行业动态 ------ 人浏览过-----时间:2018-5-4 0:58:39

菌群中鉴别微生物-培养的细胞检测显微镜

 
  被鉴定为属于未培养的古生菌,如ANME一2。这些菌周围是硫酸盐
还原菌群。这些工作为生物代谢中甲烷氧化提供了有力证据。虽然13c
标记参与甲烷氧化是可以断定的并且靠SIMS分析已经得到解释,但不利
用加入标记的培养基其他形式的C代谢可能更难说明。利用荧光标记的
寡核苷酸探针来研究细胞固定或杂交需要考虑外加碳源的同位素干扰。
  单细胞同位素标记技术主要局限是它们只能提供可标记或可同位素
示踪的培养基代谢信息。这不利于我们对整个单细胞代谢过程的描绘。
对于这个结果,两种新的基于PCR的方法已经得到发展,保证了复杂环
境样本中单细胞基因内含物的分离。第一个技术是末端微流数字PCR配
合16S rDNA鉴定单个未被培养的细胞,并同时检测这些细胞中的其他基
因。利用微流设备从复杂混合物中稀释并分离细胞。这个分离步骤很关
键,分离出的细胞将分别作为多重复PCR反应的模版。虽然到目前为止
,这项技术只被用于将研究特定代谢基因与木养白蚁后肠中一种细菌的
联系,但原则上,它能够应用于任何基因与16S rDNA已鉴定的单细胞之
间。这项技术能分开独立应用于不同时期的细胞(在成熟,基因表达或
基因定位)研究中。而且,单细胞PCR的应用避免了PCR人为误差,例如
扩增误差和非设计性产物等。随着白蚁后肠的研究,相似的微流技术已
用于人类牙龈缝隙中分离的微生物。在这项工作中,基因组从目标个体
细胞扩增,保证了它的基因扩增大于1000。随着单细胞基因组序列方法
的发展,未来会有更好的基因组技术出现。这项研究的有利之处在于它
能在复杂的菌群中鉴别出催化目标反应的微生物(例如,检测特定功能
基因的出现)。在这方面它与同位素阵列或SIP相似,对于微流数字PCR
技术细胞作为区别实体信息被保存。

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