本文标题:"微生物多态激光检测仪分析图像显微镜"
发布者:yiyi ------ 分类: 行业动态 ------
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微生物多态激光检测仪分析图像显微镜
另一种解析从DNA提取物扩增出的混合16S rDNA的方法是变性梯度
胶电泳(DGGE),可以将同样长度仅有一两个核苷酸差异的片段分离开。
接着用rDNA与已知生物的寡核苷酸探针在电泳条带上以杂交的方式来鉴
定与探针成功杂交的相应生物。如果需要纯化,电泳胶的条带可以经洗
脱,再扩增,确定他们的核苷酸序列。这些序列接下来可以到对应的数
据库进行序列比对来确定是否曾被报道。第二个主要的微生物指纹图谱
技术是末端限制性片段长度多态。t—RFLP通过限制性酶识别序列,它
根据特异性限制位点分解DNA分子。得到的片段按大小分开。单个片段
的分离是由于PCR引物中的一个带有荧光标记,当接近这个引物的片段
迁移经过激光检测仪时就检测到DNA序列。虽然这是一种比较不同模版
的多态性的简便方法,但t—RFLP对于正确分析多态性差异还比较繁琐
。另外,DNA微阵列将被用于一个环境样本中微生物多样性的快速评估
这种以16S rRNA为基础的微生物多态性评估方法的重要前提是16S
rRNA基因存在于片段中,并且有时呈多态和单基因拷贝(Klappenbach等
,2001)。其他可能影响以PCR一为基础的16S精确评价的因素包括,潜
在的基于膜分化耐受性产生的细胞裂解能力的不同对核苷酸扩增的影响
;细胞颗粒吸附或包埋在复合培养基中使其无法收集;共提取的污染物
可能妨碍下游程序,DNA剪切导致嵌合产物,
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