膀胱切片检查在IC的诊断地位仍是众说纷纭，大部分北美地区的医师仍靠着临床症状及膀胱镜检的标準来诊断IC，膀胱切片的目的仅在于去除是否合併其他特殊疾病（如癌症）及确认病患某种特殊的病理变化。藉者切片检查可以让我们更了解病患的炎症反应程度及型态，甚至膀胱纤维化程度，进而预测其预后。相反的在欧洲地区，切片检查被认为是诊断的必要步骤（13），此种依赖切片结果来诊断IC或许用来说明欧洲及日本地区IC盛行率较北美为低的原因。总括来说，切片的结果并非是IC病理上所特有，无法作诊断的依据，IC可能是不同的病因对膀胱产生伤害，因而造成複杂的症候群。